Por tudo que tenha pesquisado e me tenham dito, se ficarem colocados na 2ª fase a matrícula da 1ª é automaticamente anulada.
Até porque os alunos que estão matriculados e a concorrer à 2ª fase, caso entrem, a vaga que deixam livres da matrícula ser automaticamente anulada fica automaticamente preenchida por outra pessoa já na 2ª fase.
Vi tanto no Uniarea, como no Inspiring Future, como no Podcast Universitário. Além de já ter perguntado eu própria e ter visto a questão inúmeras vezes. Não há nada a fazer, se ela for colocada a anterior é anulada