Boa noite.
O ponto 4.6 - Melhoria de classificação, destina se aos alunos que já tenham terminado a disciplina/curso e que pretendem melhorar a classificação interna da mesma. Como estás no 11°ano, presumo que ainda não tenhas terminado nenhuma disciplina, pois elas são bienais e trienais, só no 12° ano é que tens anuais.
Exemplo: Imaginemos que tu vás fazer o exame de inglês e por acaso é uma das disciplinas do curso em que andas (Línguas e Humanidades por exemplo), porém estás no 11°ano, ou seja, não podes fazer melhoria de nota, sem antes concluires esta disciplina.
Presumo que seja por isso que a escola tenha mandado a retificação, mas o melhor mesmo é falar com eles pessoalmente, posso estar errada em algum ponto.