Olá!
Às disciplinas em que fazes frequências, não poderás ir a exame normal (a não ser que haja alguma nota mínima que tenhas que ter na primeira frequência para poderes ir à segunda e que não a tenhas conseguido). No caso de quereres obter aprovação às cadeiras em que não conseguiste nota por frequência ou no caso de quereres realizar alguma melhoria à tua nota obtida pelas frequências, podes sempre ir ao exame de recurso.
No caso de teres cadeiras em que a avaliação é total ou maioritariamente por exame, então aí sim, terás que o realizar. Como no caso anterior, poderás ir sempre ao exame de recurso para conseguir obter aprovação ou para efeitos de melhoria de nota.