Eu diria que não é assim tão necessário ter tido Biologia e Geologia (bienal) para entender a matéria de Biologia (12° ano). Se bem me lembro, os únicos conceitos necessários foram "mitose" e "meiose" e isso é algo que consegues perceber rapidamente e que a tua professora deverá rever inicialmente. A disciplina é bastante simples e não aprofunda muito nos pormenores, portanto eu diria que consegues perfeitamente fazê-la sem problema.
Relativamente à outra parte da questão, se o curso em questão pede como prova(s) de ingresso outros conjuntos que não incluem Biologia e Geologia, então à partida não vai ser o facto de teres tido ou não BG (10°/11°) e/ou Biologia (12°) que vai ser determinante para fazeres o curso. Contudo, isso não significa que não possa ser útil. Mesmo assim, não vai ser a opcional de 12° ano que te vai preparar para isso, creio eu.
Assim sendo, se tiveres mesmo curiosidade, escolhe Biologia no 12°. Se só estás a pensar escolher porque estas preocupado por causa do curso superior, então acho preferível escolheres outra (se gostares mais). Não é uma disciplina opcional de 12° que vai fazer diferença. Se o curso não pede o exame nacional de Biologia e Geologia (já vi que não, uma vez que tens Geometria descritiva) , então vão-te ensinar tudo o que precisas.